提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
（新春走基层）“中国年糕之乡”浙江慈城产销两旺：“捣”出醇香年味******
中新网宁波1月12日电(林波 刘雨 陈丽萍)过年吃年糕，寓意着年年高。随着春节临近，在素有“中国年糕之乡”美誉的浙江省宁波市江北区慈城镇，年糕迎来了产销旺季。
近日，在慈城年糕产业园，空气中弥漫着年糕刚刚出炉的清香，不少企业正热火朝天地加紧生产，“捣”出醇香年味，满足广大消费者对春节的期许。
经过淘米、磨粉、蒸粉等多道工序，伴随着热腾腾的雾气，雪白的年糕不断地从机器中一根一根冒出来。
企业采购的春节年货。 刘雨供图“这两天我们生产时间超过12个小时，基本上从上午一直生产到半夜，一天使用的大米原料就超过13000斤。”该园区内的一家食品科技有限公司负责人许福军表示，在相关部门的帮助下，企业克服了疫情等不利因素影响，总体呈现向好态势。
据了解，慈城年糕企业原先分布在小镇各地，多为作坊式生产，规模不大，加之疫情影响使得资金一度吃紧，生产效率拉低，发展进程受阻。
为此，江北区相关部门通过培育品牌、建设产业园区、成立产业协会、开展地理标志质押融资等多项举措，不断提升慈城年糕影响力、竞争力，推动年糕产业提档升级。
2018年，江北区大力筹建慈城年糕产业园，组织年糕产业上中下游的33家企业成立了慈城年糕产业协会，并指导协会制定地方标准、行业标准和团体标准，推动产业集聚发展和升级转型。
目前，该园区内已有3家上规模的年糕生产企业，并且每家企业都已实现阳光工厂，最大限度保证消费者舌尖上的安全。
“入驻园区后，我们引入了不少机械化的辅助手段。如今在新技术的帮助下，真空包装的年糕保质期可以达到半年以上。”该园区内一家粮油食品有限公司负责人吕国华表示，通过生产工艺改进，该公司目前高峰期的年糕日产量可以达到10吨，产品主要供应各大商超，也有不少企业采购作为春节年货。
除了传统年糕产品外，慈城年糕生产企业还积极迎合市场需求，推出了艾草年糕、红糖年糕、南瓜年糕等花式新品。
据该园区内的一家食品有限公司负责人纪平介绍，该公司投入数十万元用于产品研发及包装创新，“通过生产特色年糕、销售特色礼包等方式，转变销售思路，拓展销售市场。”
目前，慈城年糕年生产力近万吨，年销售额近亿元，产品畅销海内外，带动了当地农户增收，已经成为江北一张亮丽的金名片。(完)
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